巧克力囊肿是否可以备孕需要根据具体情况判断。如果巧克力囊肿较小，并且没有出现不适症状，则一般不需要治疗，此时是可以备孕的；但如果巧克力囊肿较大，或者出现了明显的不适症状，则建议先进行手术治疗，然后再考虑备孕。

1.可以备孕：巧克力囊肿是一种常见的妇科疾病，主要是由于异位的子宫内膜在卵巢内生长，随着月经周期而出血，形成存在陈旧性积血的囊肿。如果患者的巧克力囊肿体积比较小，并且没有出现明显的不适症状，这种情况一般是不需要特殊处理的，在这种情况下患者也是可以正常备孕的。因为在这种情况下，患者不会影响正常的受孕概率和胎儿发育情况。

2.不建议备孕：但是如果患者的巧克力囊肿体积比较大，并且已经出现了明显的不适症状，比如痛经、月经失调等，则是不建议备孕的。因为在这种情况下，患者可能会导致卵泡无法排出，从而影响到怀孕的概率。建议患者及时就医，在医生指导下通过腹腔镜手术等方式进行治疗后再进行备孕。

另外，在日常生活中，患者要注意做好保暖措施，避免着凉，同时还要注意保持良好的心态，避免情绪激动，以免加重病情。若期间出现明显不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。