杀牙神经后牙齿还疼，有部分是牙神经没有杀干净，也有部分是其他原因导致，比如咬合面过高、牙龈炎、根尖周炎等。具体分析如下：
一、牙神经没有杀干净：
即还有少量的牙神经残留在牙髓腔内，在发生感染或者受到刺激的时候就会出现疼痛。这种情况需要再次去医院做根管治疗，将残留的牙神经杀死或者取出来。
二、其他原因：
1、咬合面过高：杀牙神经治疗后，通常需要将牙洞填充好，如果咬合面过高，在咬东西的时候就会对与其相对应的牙齿造成刺激，引起疼痛。需要去医院进行调整，将咬合面磨低。
2、牙龈炎：患有牙龈炎，牙龈会出现充血、水肿以及疼痛，有可能会牵涉到与牙龈交界的牙根部位，自己以为是牙齿疼痛。需要保持口腔清洁卫生，遵医嘱应用抗炎或止痛的药物进行治疗，如口服阿莫西林胶囊、布洛芬缓释胶囊等。
3、根尖周炎：是指发生于牙根尖周围组织的炎症性疾病，常为牙髓病的继发病。多是由于牙髓腔内部的细菌感染通过根尖孔向根尖周围的组织扩散所致。根尖周炎分为急性根尖周炎、慢性根尖周炎，急性根尖周炎的症状主要表现为自发痛、咬合痛，根尖部牙龈肿胀，疼痛逐渐加重，甚至伴随发热、乏力等全身症状。慢性根尖周炎一般无明显自觉症状，当患牙进行咀嚼动作时会有不适感，也可能发现牙龈上出现脓包。建议在医生指导下采用甲硝唑片、头孢呋辛酯皮、布洛芬缓释胶囊等药物治疗。情况严重者可进行根管治疗术、牙髓血运重建术等治疗。
此外，也有可能是牙隐裂、牙周脓肿、牙龈瘤、牙龈癌等导致的疼痛。建议患者及时复诊，并在医生指导下给予针对性的措施。