子宫内膜息肉手术3个月后，月经仍然不正常可能是内分泌失调、宫腔粘连等原因引起的。患者需要根据不同的原因采取相应的治疗措施。

1.内分泌失调：如果在进行子宫内膜息肉手术时，对身体造成了较大的损伤或者术后没有注意休息和护理，可能会导致内分泌失调，从而出现月经异常的情况。建议患者可以在医生指导下使用益母草颗粒、乌鸡白凤丸等药物进行调理。同时还要注意饮食健康，多吃一些富含雌激素的食物，比如豆腐、豆浆等，能够补充体内所需要的雌激素，在一定程度上也能够改善症状。

2.宫腔粘连：如果在进行子宫内膜息肉手术时，由于操作不当或者是术后炎症刺激等因素，可能会引起宫腔粘连，从而影响到正常的月经周期，也会出现上述情况。此时可以遵医嘱通过宫腔镜下宫腔粘连分离术的方式进行治疗。另外，还可以在医生的指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等抗生素类药物预防感染。

除此之外，还可能与宫颈炎、盆腔炎等疾病有关，建议患者及时就医，查明具体病因后再进行针对性地治疗。