精子畸形率高，一般需要先查明病因，再根据病因进行针对性处理，如不良生活习惯、感染、精索静脉曲张、内分泌异常等。

1、不良生活习惯：精子畸形率高，可能是由于长时间抽烟、喝酒，以及过度熬夜、饮食不健康等因素导致。一般可以通过改善生活习惯进行调整，如戒烟戒酒、规律作息、清淡饮食、避免熬夜，以及适当运动等，严重者可遵医嘱使用生精胶囊等药物治疗;

2、感染：如果精子受到感染，也可能导致精子畸形率高，建议遵医嘱使用抗生素进行治疗，如盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等;

3、精索静脉曲张：患者可能会因睾丸部位血液循环不良，而导致精索静脉曲张，从而造成静脉回流受阻，引起生殖细胞死亡，导致精子畸形率高。建议及时就医，并遵医嘱行腹腔镜下精索静脉高位结扎手术，或是纤维镜下精索静脉结扎术等进行治疗;

4、内分泌异常：男性体内激素水平异常时，也可能会导致精子畸形率高。建议男性日常保持良好的生活习惯，如果是疾病引起的雄激素分泌不足，一般可以通过补充雄激素的方式进行治疗，如遵医嘱使用十一酸睾酮软胶囊。

另外，先天染色体异常、严重外伤、长期接触化学毒物等，也可能会导致精子畸形率高。此时建议男性及时就医，根据病因进行针对性处理。