阴茎上黑色疣可能是尖锐湿疣，也有可能是色素痣、扁平疣、鲍温样丘疹病等疾病导致。建议患者及时前往医院就诊，完善相关检查，明确诊断后进行针对性治疗。

1、尖锐湿疣：如果平时不注意个人卫生，有多个性伴侣，可能会感染人乳头瘤病毒，从而诱发尖锐湿疣。由于局部组织增生，会导致阴茎上出现黑色的赘生物，并伴有疼痛、瘙痒等症状。此时可以在医生指导下外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗；

2、色素痣：可能与遗传因素有关，也可能与紫外线照射有关，可导致黑色素细胞良性增生，从而引起上述情况。一般不需要特殊治疗，如果觉得影响美观，可以采取激光手术去除；

3、扁平疣：是由人乳头瘤病毒感染引起的病毒性皮肤病，主要通过直接接触或间接接触传播。如果发生在阴茎部位，则可能导致阴茎上出现黑色的赘生物，并伴有轻微瘙痒感。此时可以遵医嘱外用维A酸乳膏、水杨酸软膏等药物进行治疗；

4、鲍温样丘疹病：是一种少见的皮肤原发性肿瘤性疾病，发病原因尚不完全清楚，可能与免疫功能低下有关。当病变累及阴茎时，则可能导致阴茎上出现黑色的赘生物，并伴有疼痛、瘙痒等症状。此时可以遵医嘱使用氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗。

还可能是皮脂腺囊肿等原因导致。日常生活中要注意个人卫生，勤洗澡，勤换洗内裤。