风油精对于扁平疣效果不好，一般不用于治疗扁平疣，目前治疗扁平疣的方法主要有药物治疗、手术治疗及日常护理。
扁平疣是病毒感染导致角质细胞异常增殖引起的。治疗上可外用干扰素喷雾剂、咪喹莫特乳膏等抗病毒药，或维A酸乳膏、他扎罗汀乳膏等溶解角质类的药物。扁平疣长期不痊愈可口服匹多莫德口服液、转移因子口服液或甘露聚糖肽胶囊等增强免疫力的药物。
手术治疗扁平疣一般是指埋疣疗法，就是取一小块疣体，然后埋在胳膊或大腿处，刺激身体产生相应的免疫抗体，利用免疫抗体去除病毒。
扁平疣患者平时要注意早睡早起，适当锻炼，提高身体免疫能力，防止扁平疣治疗后持续不消退。发病期间要避免别人接触疣体以免互相传染，治疗期间应清淡饮食，不要饮酒。