莫名其妙睾丸疼有可能是睾丸炎、睾丸扭转，还有睾丸损伤等原因引起的。
1、睾丸炎：如果患有慢性前列腺炎或者是流行性腮腺炎等疾病时，随着病情的发展有可能会诱发睾丸发炎，从而引起睾丸肿大，出现莫名其妙睾丸痛的症状。
2、睾丸扭转：如果睾丸受到外力或者是经常做剧烈活动时，有些人在睡眠或者是安静时可能会出现睾丸扭转的情况，而引起睾丸出现莫名其妙剧烈疼痛，甚至伴有恶心、呕吐、阴囊肿胀等不适的症状。
3、睾丸损伤：遭受的暴力或者是车祸等外在影响时，都有可能会导致睾丸损伤，从而引起睾丸部位出现莫名其妙疼痛的情况。
莫名其妙睾丸疼有可能是其他方面原因引起的，建议尽早的到医院做检查，明确病因再针对性治疗。治疗期间要注意个人卫生。