金水宝和六味地黄丸是两种不同的药物，它们的药物成分、功效作用以及适用范围都是不同的，因此不存在哪一个更好的说法，它们都是药效比较不错的中成药物。
1、药物成分：金水宝的主要成分是发酵虫草菌粉，还含有多种氨基酸、维生素以及微量元素等。六味地黄丸主要是由熟地黄、山茱萸、牡丹皮、茯苓、山药、泽泻等组成。
2、两者的功效作用不同：金水宝主要可以补肺益肾、扶正补虚等，而六味地黄丸的主要功效包括滋补肝肾阴虚等。
3、两种药物的临床适用范围也存在区别：金水宝适用于肺肾虚、精气不足、久咳虚喘、疲乏无力、失眠健忘、腰膝酸软、女性月经不调、男性阳痿早泄、慢性支气管炎、慢性肾功能不全等。六味地黄丸主要用于头晕耳鸣、腰膝酸软、潮热、盗汗遗精等的治疗。