睡觉腰两侧痛，起床就不痛了，可能与腰肌劳损、腰椎骨质疏松症、腰椎间盘突出症等因素有关。建议及时就医并进行相应治疗，防止病变加重。
1、腰肌劳损：可能与受凉或过度弯腰等因素有关，在睡觉时姿势不当，使肌肉受到牵拉和挤压，可引起疼痛感，起床以后疼痛可减轻或消失。可应用抗炎镇痛类药物改善，例如吲哚美辛片、塞来昔布胶囊、美洛昔康片等。
2、腰椎骨质疏松症：与营养吸收障碍以及雌激素缺乏有关，休息时间过久，使腰部出现酸痛感，起床适当活动，症状可减轻。病变较严重时，可应用葡萄糖酸钙口服液、枸橼酸钙片、利塞膦酸钠胶囊等药物治疗。
3、腰椎间盘突出症：患有腰椎间盘突出症，床垫过软或者是姿势不正确，使病变加重，可引起腰痛、下肢疼痛、下肢麻木等症状。确诊以后可进行骨盆牵引，配合口服维生素B族片、甲钴胺片、塞来昔布胶囊等。
除以上因素以外，还可能是腰椎肿瘤导致的该症状。如果症状持续，建议及时就医诊治。在治疗期间要遵医嘱安全用药，同时也要做好各方面护理。