发烧指发热。连续两天发热39℃可能是急性上呼吸道感染、肺炎、肺结核等原因，患者可以根据具体原因进行对症治疗。
1.急性上呼吸道感染：如果上呼吸道感染了病毒、细菌等病原体，引起炎症反应，可能会刺激机体体温调节中枢，进而出现发热现象。建议患者遵医嘱使用对乙酰氨基酚片、布洛芬片等药物，缓解发热症状，减轻疼痛。
2.肺炎：如果过于劳累或受凉，可能会导致肺炎链球菌入侵人体，从而产生发热的情况。建议患者遵医嘱使用阿奇霉素片、左氧氟沙星片等药物，杀灭细菌。
3.肺结核：如果身体感染了结核分枝杆菌，在体内大量生长繁殖，产生一些毒素进入血液，可能会变成一种致热源，刺激身体发热。建议患者遵医嘱使用异烟肼片、盐酸乙胺丁醇片等药物，杀灭结核分枝杆菌，促进身体恢复。
如果患者想要确定高热39℃的原因，需要及时前往医院进行血常规、X线检查、CT检查等检查。日常生活中保持室内空气的流通，注意饮食清淡。