手指甲里长了小黑刺，首先要考虑是否因为有异物进入而引起的，除此之外可能是皮肤类疾病、局部外伤或缺乏微量元素等原因所导致。
1、异物进入：当手指甲内有异物进入时，会导致指甲内部出现病变，毛细血管破裂，看上去像是指甲里长了小黑刺，此时应及时就医，采取消炎治疗。
2、皮肤类疾病：指甲里长了像小黑刺一样的东西，可能是甲母痣，主要呈现为黑色的黑线，所以看上去就像刺一样，甲母痣有癌变的可能，需及时给予手术切除治疗。
3、局部外伤：若指甲被外力砸伤或挤伤时，就会导致指甲内部的毛细血管破裂，而产生局部出血、组织损伤，从而表现为手指甲内有小黑刺，此时应进行消炎治疗，可使用碘伏、红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物治疗。
4、缺乏微量元素：当身体内缺乏微量元素时，会致使手指甲部位缺乏营养而出现黑色的细纹，看起来像是手指间里长了小黑刺一样，此时需到医院进行详细检查，根据检查结果补充缺乏的微量元素。