吃了三个月氨糖后全身关节都疼，可能是用药量过大、药物过敏、药不对症、不良生活习惯等原因导致的。建议及时就医，在医生指导下采取相应的措施。具体如下：
1、用药量过大：虽然氨糖氨基葡萄糖具有保护关节软骨的作用，但过量服用可能产生副作用。连续服用三个月且剂量过大时，可能导致全身关节疼痛。此时应咨询医生，适当停药或减药，症状通常会得到缓解。
2、药物过敏：体质敏感者连续服用三个月氨糖后，过敏概率可能增加。过敏症状因人而异，但少数人可表现为全身关节疼。若确定是过敏所致，应立即停药并观察症状是否缓解，必要时在医生指导下使用抗过敏药物。
3、药不对症：如果关节病变部位不在软骨，如患有风湿或类风湿关节炎，单纯服用氨糖可能无法有效改善关节疼痛。此时应及时就医查找病因，并进行针对性治疗。
4、不良生活习惯：在服用氨糖期间，如伴有剧烈运动、过度劳累或寒冷刺激等不良生活习惯，也可能导致关节疼痛。因此，在用药期间应注意休息、保暖，避免症状加重。
在日常生活中，需要在医生的指导下服用药物，避免自行调整药量或停药，可能会影响治疗效果。