上下牙齿之间最里面那块肉特别疼，有可能是智齿冠周炎、溃疡、疱疹、牙周脓肿、牙槽脓肿、急性龈乳头炎或者黏膜下纤维性变等，建议到医院就诊，根据不同病因采取针对性治疗，具体如下：
1、智齿冠周炎：智齿冠周炎是在智齿表面形成了盲袋，导致细菌感染。一般需要做冠周冲洗，并且局部上药来促进愈合，常用的药物是碘甘油、盐酸米诺环素软膏等。
2、溃疡：由于牙缺失或者牙齿位置偏等，牙齿会咬到对面的牙床造成溃疡，也有可能是由于细菌感染、创伤等出现溃疡导致疼痛。建议拔除多余的创伤牙。
3、疱疹：由于病毒感染形成了疱疹，在牙龈表面也能够出现。疱疹常需要抗病毒治疗，常用的药物是阿昔洛韦片或者利巴韦林片等。
4、牙周脓肿：后面的牙齿如果有牙周炎没有及时治疗，形成了牙周脓肿，表面的肉就会特别的疼。有波动感的需要切开引流缓解疼痛，没有波动感的需要做牙周治疗。
6、急性龈乳头炎：牙齿周围出现食物的嵌塞压迫，可能会有急性龈乳头炎的现象，疼痛感像牙髓炎一样。一般需要做局部的冲洗，去除嵌塞的食物，如果有龋齿及时充填。
7、黏膜下纤维性变：由于咀嚼槟榔、吸烟等可能会使黏膜出现变化，黏膜的纤维性变会出现疼痛感。必要时需手术治疗，一般建议保持好口腔的良好习惯，不要吸烟和咀嚼槟榔。