儿童感染新冠肺炎会有后遗症。儿童感染新冠肺炎后可能会面临各种严重的后遗症。包括呼吸短促、肌肉疼痛、头痛、疲劳、睡眠障碍、胸痛、脱发、消化系统疾病、味觉和嗅觉丧失、体重减轻、注意力不集中、记忆丧失等。

新型冠状病毒可导致肺磨玻璃混浊、支气管扩张、结节、纤维化等。新型冠状病毒持续存在肺损伤和机械通风，医源性肺损伤可诱发新型冠状病毒感染后肺纤维化。因此，患者的弥散能力和呼吸强度下降，导致运动能力和健康状况下降。新型冠状病毒可导致心功能障碍、心肌炎、心肌病、心律失常的风险。新型冠状病毒可导致肾脏血尿、蛋白尿和白细胞血栓形成、色素管型、巨核细胞增多和肾小球病。新型冠状病毒可导致特发性血小板减少性紫癜。新型冠状病毒肝脏急性损伤主要表现为肝酶升高。亚急性甲状腺炎可由新型冠状病毒引起。新型冠状病毒可能对大脑产生长期影响。患者在康复过程中会出现心理或神经后遗症，导致四肢麻木、抑郁、焦虑和创伤后应激障碍，并伴有头晕、头痛、化学感觉功能持续丧失和严重的认知障碍。