降低精子畸形率，需要根据病因进行相应的处理，常见病因包括不良生活习惯、感染、精索静脉曲张、内分泌异常、免疫因素等。

1、不良生活习惯：需要戒烟、戒酒，避免熬夜以及过度劳累，保证充足睡眠，同时避免接触化学放射性物质等，可以辅助降低精子畸形率;

2、感染：如淋菌性尿道炎等，可以导致精液中出现炎症细胞，引起精液不液化，可能会导致精子畸形率增高。需要遵医嘱使用敏感的抗生素进行治疗，如阿莫西林胶囊、头孢地尼分散片等，炎症好转后，精子畸形率通常会降低;

3、精索静脉曲张：可以导致睾丸的温度升高，还会引起毒性物质的堆积，从而影响到精子的质量，导致精子畸形率增高。可以通过手术方法进行治疗，如经腹腔镜精索静脉结扎术、显微镜下精索静脉结扎术等;

4、内分泌异常：如甲状腺功能亢进或者甲状腺功能减退，可能会导致精子的生成以及发育出现异常，从而导致精子畸形率增高。建议及时纠正内分泌异常，如遵医嘱使用左甲状腺素钠片等药物;

5、免疫因素：如系统性红斑狼疮等免疫性疾病，可能会引起免疫功能紊乱，导致精子发生异常改变，引起精子畸形率增高。建议遵医嘱使用醋酸泼尼松片等药物进行治疗，病情好转后，精子畸形率通常会降低。

降低精子畸形率，除了在医生指导下进行针对病因的治疗外，还建议日常生活中避免穿过紧的内裤，适当进行运动锻炼，并且保持良好的生活习惯。