抗生素：酸奶中的活性乳酸菌会被体内的抗生素杀死，所以服用罗红霉素、四环素、氯霉素和其他对乳酸菌敏感的抗生素，必须错过喝酸奶的时间。首先，乳酸菌对这些药物很敏感，其次，抗生素和酸奶中的钙离子在肠道中形成复合物，大大降低了药物的吸收，降低了疗效。

虽然同时服用酸奶会影响疗效，但服用抗生素后2小时饮用酸奶可以调节食欲不振、恶心呕吐、头晕等症状。

含铁药:硫酸亚铁、富马酸亚铁(富血铁)、琥珀酸亚铁、柠檬酸铁铵、缓释铁等含铁制剂是女性和儿童缺铁性贫血的常用药物。酸奶中的钙离子可以与十二指肠中的铁竞争，减少铁的吸收，降低疗效。

强心药物：当心力衰竭患者使用洋地黄、地高辛等强心药物治疗时，如果同时喝大量酸奶，可能会出现黄视等中毒症状，甚至发生事故，因为酸奶中含有的钙会增加这些强心苷的毒性。

降血糖药物：二甲双胍会增加体内的乳酸，而酸奶中含有大量的乳酸菌，进入人体也会增加乳酸的量。如果长期服用二甲双胍，喝酸奶会导致体内乳酸的积累，并可能导致乳酸中毒。为了避免体内乳酸的积累，其他乳制品可以在服用二甲双胍时代替酸奶。

降压药物：严重高血压患者在使用优降宁等降压药物时，如果同时喝酸奶或吃其他乳制品，可能会导致血压突然升高，严重者会继续升高血压，甚至出现高血压危象。