精子男女染色体异常，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等措施进行处理。精子男女染色体异常，是临床上较常见的一种现象，会对生育能力造成一定影响，而且这种异常染色体通常会导致患者出现先天性的畸形或者先天性疾病。

1、一般治疗：如果发现精子男女染色体异常，但未影响正常生活，如怀孕等，可以暂时不进行特殊治疗。建议在日常生活中合理膳食、适量运动、规律作息，以帮助增强身体素质，对于减少染色体异常胎儿的出生有一定好处;

2、药物治疗：如果精子男女染色体异常，导致患者出现生殖系统畸形或者先天性疾病，如不孕不育等，则可以遵医嘱应用抗氧化剂，如维生素C、维生素E等，或者是激素类药物，如左卡尼汀、他莫昔芬等进行治疗;

3、手术治疗：如果精子男女染色体异常，导致患者存在先天性的生殖系统畸形，如先天性阴茎缺如或者阴茎过小等，可以通过手术进行治疗，如阴茎矫正术等，以帮助改善上述症状;

4、其他措施：如果精子男女染色体异常，但未对正常生活造成影响，如处于妊娠期间，通常可不进行特殊治疗。如果已经怀孕，则可以在医生建议下选择无创DNA检查、羊水穿刺等方式进一步明确诊断，并遵医嘱进行规范产检。

精子男女染色体异常可能会导致先兆流产、胚胎停育或者畸形等情况的发生，建议存在此类情况的患者及时就医，在专业医生的指导下进行治疗。