精子畸形症会影响怀孕。精子畸形症是指精子的形态或者结构出现异常，通常表现为头晕、乏力、腰酸、胸闷、易疲劳、少精、弱精等症状，严重时会引起不育。

一、影响怀孕的原因：

1、遗传因素：精子的畸形率与遗传也有一定的关系，比如染色体异常，临床上多见于克氏综合征、雄激素不敏感综合征等，会导致精子的畸形率增高，从而影响怀孕;

2、感染因素：生殖系统感染也可能会导致精子畸形率高，如前列腺炎、附睾炎、精囊炎、尿道炎等，会影响精子的质量，从而影响怀孕;

3、内分泌异常：如果患者有内分泌疾病，比如甲状腺功能亢进或低下，都有可能导致精子的畸形率增高，从而影响怀孕;

4、生活习惯：如果患者经常抽烟、喝酒或者熬夜等，也会影响精子的质量，导致精子畸形率高，使精子与卵子结合后形成胚胎，从而导致怀孕困难;

5、不良习惯：男性经常手淫或者穿过紧的内裤，会导致阴茎软组织损伤，使精子畸形率提高，从而影响怀孕。

二、精子畸形症的治疗方法：

1、药物治疗：建议患者在医生指导下口服叶酸片，可以预防胎儿神经管畸形，还可以服用维生素E片可以抗氧化，同时需要加强体育锻炼，增强体质;

2、手术治疗：如果患者精子畸形率较高，可以通过手术的方法改变精子的畸形率，如精索静脉曲张高位结扎术、腹腔镜下精索静脉高位结扎术等。

通常精子畸形率高的患者可以在医生指导下选择合适的治疗方法，在备孕期间男女双方需要戒烟戒酒，注意个人卫生，尽量穿宽松的内裤。