长距离耐力运动腹痛可能是生理性因素引起的，也可能是胃肠炎、急性阑尾炎等病理性因素引起的，患者可以在医生的指导下通过日常调理、药物治疗的方式治疗。
一、生理性因素
在运动过程中，身体器官代谢过快，可能会使得局部出现不适症状，此时应通过及时休息、局部按摩等方式缓解不适症状。
二、病理性因素
1、胃肠炎：该疾病一般和饮食不当、细菌感染等因素有关，运动后可能会出现腹痛、腹泻、发热、寒战等症状，患者需在医生的建议下使用枸橼酸铋钾片、肠炎宁颗粒等药物进行治疗，有清热利湿、保护胃黏膜等作用。
2、急性阑尾炎：餐后剧烈运动、长期精神紧张等都可能诱发该疾病，患者容易出现剧烈疼痛、恶心、呕吐等症状，建议在医生的指导下选择腹腔镜阑尾切除术、开腹阑尾切除术等方式进行治疗。
除以上相对常见原因外，还可能是其他病理性因素引起的，比如胆囊炎、胰腺炎、肠梗阻等，建议患者及时前往医院进行血常规、二维超声检查、CT检查等检查，明确病因后进行针对性治疗。在运动前，还需做好热身活动，以免在运动过程中受伤。