脚底长瘊子，有先天性原因和后天性原因两种，一般通过外用药物、激光、冷冻的方法治疗，可根据患者的具体情况，选择合适的治疗方法，具体如下：
1、先天性原因：如果是先天性原因引起的，平时无不适症状，可不用治疗，如果瘊子生长迅速或者出现疼痛等不适症状时，可采用激光或者冷冻等方法治疗；
2、后天性原因：如跖疣等，多数是由于人乳头瘤状病毒感染引起的，具有一定的传染性，平时避免用手搔抓，以免感染，可外用维A酸乳膏、氟尿嘧啶软膏、三氯醋酸等治疗，直到瘊子发黑结痂后停止使用；也可采用激光治疗，将瘊子去除；也可使用液态冷冻的方法治疗，冷冻是利用低温使疣体局部病变发生低温性坏死，使瘊子肿胀脱落。
脚底长瘊子具体怎么治疗，需要到医院皮肤科就诊，在医生的指导下进行。