手指甲侧缝疼，可能是嵌甲、异物刺入、外伤、蚊虫叮咬、甲沟炎等原因所致，建议及时就医，在医生指导下给予相应的改善或治疗措施。具体如下：
1、嵌甲：将手指甲剪得过短或者是经常的挤压手指甲，很可能会造成局部嵌入到甲周软组织，引起局部疼痛不适的症状。可以使用牙线或者是棉花丝置入嵌甲下方，通常可以改善嵌甲的生长方向，也可以使指甲逐渐的向正常的方向生长，通常可以起到纠正嵌甲的目的。
2、异物刺入：植物毛刺或者是玻璃碎屑刺入到指甲周围的软组织，可能会形成异物刺入的状态，表现为指甲盖缝疼痛的症状。通常需要明确异物刺入的位置，并且使用专业的工具将异物取出，症状也会逐渐的得到好转。
3、外伤：手指甲部位在受到外伤磕碰或者是指甲受到挤压伤，有可能会造成软组织受损，表现为局部充血引起肿胀的症状，还可能会产生无菌性炎症。在受到炎症刺激之后，也会造成指甲边缘疼痛的状况。在平时一定要注意做好手部的护理工作，减少对局部刺激。必要时可以遵医嘱使用红霉素软膏、他克莫司软膏、莫匹罗星软膏等药物涂抹治疗，有助于预防和治疗局部发炎的症状，也能够改善流脓现象，有助于促进局部恢复。
4、蚊虫叮咬：被蚊虫叮咬了，指甲周围的软组织很可能会造成局部炎症反应，也会表现为局部疼痛的症状，建议做好局部的清洁卫生工作。必要时可以在医生指导下使用林可霉素利多卡因凝胶、双氯芬酸二乙胺乳胶剂、炉甘石洗剂等方法治疗，能够起到止痒的作用，也能够减轻疼痛症状。
5、甲沟炎：甲周组织轻微损伤的基础上感染各种致病菌通常会造成甲沟炎，如果情况较为严重，也会引起周围的组织红肿疼痛等症状还可能会表现为局部疼痛。可以使用碘伏对局部消毒，也可以在医生指导下使用莫匹罗星软膏、克拉霉素胶囊、红霉素软膏等药物进行治疗，可以起到消除炎症的作用，也能够减轻症状。
除此之外，也可能是甲癣等原因造成的，在平时需要做好自身的护理工作，减少对手指的刺激，如果症状持续加重，可以到医院明确诊断之后采取治疗措施。