脖子上皮肤疼，有黑色素沉淀，可能与皮肤晒伤、色素痣、炎症后色素沉着、黑棘皮病等原因有关，建议明确诊断后进行针对性的治疗。具体分析如下：
1、皮肤晒伤：脖子上皮肤若长期受到紫外线的照射，会出现黑色素沉淀、皮肤疼痛等症状，建议日常生活中注意防晒，如涂抹防晒霜、出门打伞等。
2、色素痣：属于黑色素的良性增生，皮损表现为斑疹、丘疹等，颜色可呈黑色，若面积较小，一般不需要治疗，可用遮瑕霜遮盖。若影响美观，可选择物理、手术等方式治疗。
3、炎症后色素沉着：常见于炎症性皮肤病，如带状疱疹、疱疹样皮炎、虫咬皮炎等，因皮肤急慢性炎症引起色素沉淀，可遵医嘱选择维A酸乳膏、地奈德乳膏、氢醌乳膏等药物治疗。
4、黑棘皮病：好发于皮肤褶皱部位，如颈部、腋下等处，主要表现为皮肤色素沉淀、增厚等，可能与肥胖、肾上腺病变等因素有关，可遵医嘱选择维A酸乳膏、盐酸二甲双胍片、卡泊三醇软膏等药物治疗。
除此之外，黑色素瘤等也会引起以上症状。建议患者及时就医，明确诊断，在医生的指导下进行规范性治疗。