跑完步后脑袋两侧疼可能是运动量比较大、低血糖、身体缺氧、偏头痛、高血压等病理因素引起的。可通过日常调理、使用药物的方式改善相关情况。
1、运动量比较大：由于跑步的运动量比较大，导致心跳加快，进而造成大脑的供血不足，大脑供血不足后就会产生缺氧的症状，从而出现跑完步脑袋胀痛的情况。一般无需经过特殊治疗，在适当休息后，症状会得到缓解。
2、低血糖：低血糖一般指体内的血糖浓度过低，通常与内源性胰岛素分泌以及胰岛素拮抗激素缺乏有关，有时候营养不良也会引起低血糖的症状。低血糖患者会出现头晕以及恶心的症状，在进行剧烈运动后，会导致体内的血糖值更低，从而出现脑袋胀痛的现象。患者可适当服用糖水，可帮助缓解症状。
3、身体缺氧：跑步过程中，身体中的血液循环主要聚集在四肢肌肉部位，可能影响心脏的正常泵血功能，导致颅脑轻度缺血、缺氧，从而引发疼痛。跑步时注意调整呼吸节奏，避免呼吸急促导致的缺氧。
4、偏头痛：跑步时偏头痛发作，可能导致脑袋两侧疼痛。建议遵医嘱使用布洛芬片、吲哚美辛片、尼莫地平片等药物进行治疗。
5、高血压：高血压一般是体内的血压值比正常值高，通常与肥胖、情绪激动等因素有关。若患者突然血压升高，大脑内的毛细血管扩张充血，就会使患者出现脑袋胀痛的现象，患者可遵医嘱服用硝苯地平片、苯磺酸氨氯地平片等药物进行降压治疗，有助于缓解症状。
若患者出现上述症状，建议及时到医院完善相关检查，明确具体病因后进行对症治疗。平时注意多休息，避免剧烈运动，有助于缓解症状。