肛门轻微疼痛，多考虑是不良饮食习惯引起的，但也不排除是痔、肛周湿疹、肛裂、肛周脓肿等疾病造成的，可以根据引起的原因在医生的指导下给予针对性的治疗。具体如下：
1、不良饮食习惯：经常吃辛辣刺激的食物，可能会刺激肛周组织，出现局部红肿、隐痛等症状。患者需要合理调整饮食，适量食用清淡易消化的食物，比如小米粥、猕猴桃等，能够促进胃肠道蠕动，有利于大便排出，从而缓解不适。
2、痔：可能是不良排便习惯引起的，常见的症状有肛门瘙痒、疼痛等，患者可以在医生的指导下使用复方角菜酸酯乳膏、痔疮栓、高锰酸钾溶液等药物治疗，严重时还可以通过痔切除术、胶圈套扎疗法等方式改善。
3、肛周湿疹：是指肛门周围皮肤出现炎症反应，一般会出现丘疹、水疱、糜烂等症状。患者可以在医生的指导下使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏、炉甘石洗剂等药物治疗。
4、肛裂：是指齿状线下肛管发生破裂，可能会出现排便时疼痛、便血等症状。患者可以在医生的指导下使用盐酸利多卡因凝胶、乳果糖口服溶液、番泻叶等药物治疗，能够保持大便通畅。
5、肛周脓肿：是直肠肛管组织出现脓肿，一般会出现局部压痛感、肛门周围瘙痒感等症状。患者可以通过脓肿切开引流术治疗，能够将局部的脓液引流出来。
日常生活中观察个人病情变化，若出现加重的情况，需要立即就诊。