甲胎蛋白偏低并没有临床意义，也没有什么原因造成，属于正常的；甲胎蛋白偏高才有临床意义，可由肝癌、急慢性肝炎、妊娠、生殖细胞肿瘤等引起。
甲胎蛋白主要由胎儿肝细胞以及卵黄囊合成，正常人体内甲胎蛋白通常低于10ng/ml，甲胎蛋白偏低属于正常现象，没有临床意义。当发现甲胎蛋白偏低时，不需要担心；但如果发现甲胎蛋白升高，则应当及时前往医院就诊，明确升高原因，并进一步治疗。当甲胎蛋白升高时，可能提示以下：
1、当肝脏发生恶性肿瘤时，甲胎蛋白会明显升高，进一步通过肝脏影像学检查可确诊。
2、急慢性肝炎患者发生肝损伤，肝细胞再生时，甲胎蛋白也会升高，升高程度越高，提示肝细胞再生能力越强。
3、妊娠期间，由于胎儿体内存在较多甲胎蛋白，可导致孕妇血液中甲胎蛋白升高，在妊娠结束后可恢复正常。
4、生殖细胞肿瘤也会引起甲胎蛋白升高，例如畸胎瘤、卵黄囊瘤等，可联合血清β~HCG诊断。