长期不明原因间断发热，可能是由于病毒性感冒、甲状腺功能亢进症、肺炎、肺结核、肿瘤等原因导致。可针对不同的原因采取药物治疗。建议及时就医，可在医生指导下给予针对性的一般治疗、药物治疗等。具体如下：
1、病毒性感冒：感染可能引起机体免疫反应，导致体温调节中枢紊乱，从而出现发热症状。此外，感染还可能引起炎症反应，导致炎症介质释放，进一步加剧发热。症状轻者可不进行特殊治疗。若发热38.5°C以上，可在医生指导下服用对乙酰氨基酚片、布洛芬片、利巴韦林颗粒等退热药治疗。
2、甲状腺功能亢进症：甲状腺激素分泌过多，导致身体代谢活动加快，系统兴奋性增高，从而引发一系列症状。由于甲状腺激素水平的升高，导致人体处于高代谢的状态，此时交感神经兴奋，引起人体怕热、多汗等症状。在医生指导下使用丙硫氧嘧啶片、甲巯咪唑片、醋酸地塞米松片等药物治疗。
3、肺炎：肺炎时，肺部受到感染，导致炎症反应，使体温调节中枢紊乱，从而出现发热症状。此外，肺炎还可能引起机体免疫功能的异常，导致机体对感染的抵抗能力下降，容易感染疾病，从而引起发热。遵医嘱使用阿莫西林克拉维酸钾片、盐酸左氧氟沙星片、吲哚美辛片等药物治疗。
4、肺结核：结核分枝杆菌在体内大量生长繁殖后，会导致机体出现免疫反应，释放大量白细胞和巨噬细胞，这些细胞会吞噬结核分枝杆菌，从而导致发热。在医生指导下使用利福平胶囊、盐酸乙胺丁醇片、异烟肼片等药物治疗。
5、肿瘤：由于肿瘤患者免疫功能相对较弱，容易合并各种感染，导致炎症反应和发热。此外，肿瘤本身有时也会引起发热，这可能与肿瘤释放的抗原性物质引起的机体免疫反应有关。遵医嘱使用布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、阿奇霉素分散片等药物治疗。
此外，也可能是系统性红斑狼疮导致。建议避免过度劳累和剧烈运动、保持充足的水分供应、适当轻度的运动和心态，以保持身体健康。