复方鱼腥草合剂主要治疗由于咽喉疼痛、肺痈、疮疡，也可以一定程度上缓解外感风热或痰热壅肺引起的咳嗽，但不属于治疗咳嗽的专属药物。
复方鱼腥草合剂是一种糖浆类型中成药，主要由鱼腥草、黄芩、板蓝根、连翘、金银花等药物组成，具有疏散风热、清热解毒的功效，药理研究表明，复方鱼腥草合剂具有解热、抗炎、镇痛、调节免疫等作用。其中君药鱼腥草味辛性寒，归属肺经，具有清热解毒、排脓利尿的功效。复方鱼腥草合剂适用于外感风热引起的咽喉疼痛、痰热壅肺引起的肺痈或热毒壅盛导致的疮疡，也可以一定程度上缓解外感风热或痰热壅肺引起的咳嗽。
咳嗽是一种常见的呼吸道症状，《素问·咳论》曰：“五脏六腑皆令人咳，非独肺也”，导致咳嗽的病因有很多，风热袭肺、风寒闭肺、痰热灼肺、痰湿壅肺、肺脾气虚、肝火灼肺等皆可导致咳嗽的发生，依据不同的病因病机，治法亦有所不同。风热袭肺型、痰热灼肺型咳嗽可以选用复方鱼腥草合剂加减治疗。
需要注意的是，复方鱼腥草合剂以蔗糖和蜂蜜为辅料，故糖尿病患者不宜服用，此外，因其苦寒之性，孕妇、脾虚便溏者也当慎用。