双歧杆菌三联活菌胶囊通常不能长期服用。长期服用双歧杆菌三联活菌胶囊，可能对胃肠道造成刺激，导致胃肠功能紊乱诱发便秘，所以临床不推荐。
长期服用双歧杆菌三联活菌胶囊可能加重肠胃或肾脏负担，还有可能影响肠道的正常菌群，导致肠道菌群功能失调，严重时可能引起腹部胀气、腹痛、腹泻等症状，对身体的健康不利。
双歧杆菌三联活菌胶囊为西药名，是消化类药物，属于复方制剂，其主要成分为长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，性状为胶囊，药粉为白色或黄色粉末，主要用于因肠道菌群失调引起的急慢性腹泻、便秘，也可用于轻中型急性腹泻、慢性腹泻、消化不良、腹胀等症状的治疗，还能辅助治疗因肠道菌群失调引起的肉毒素血症。
建议在医生指导下服用药物，不要盲目用药，也不要长期服用，避免长期用药导致不良反应的发生。对药物里面的任何成分过敏者需禁用，药物性状发生改变需禁用，过敏体质者慎用。正在服用其他药物，用本品前建议咨询相关医师或药师。