眼上长疣不一定是哪里有问题，可能和免疫力下降、直接接触或通过污染物间接接触传染，引起的病毒疣有关。如寻常疣、扁平疣、疣状表皮发育不良，可能导致眼上长疣。
眼睛长疣，可能是人类乳头瘤病毒感染皮肤或黏膜，导致眼睛出现良性赘生物。如果身体免疫力较低、皮肤受到细小损伤、直接或间接接触病毒感染的患者及接触物，有可能发生感染。
寻常疣是由人乳头瘤病毒HPV1、HPV4和HPV7等引起，扁平疣主要是由HPV10、HPV11等人乳头瘤病毒引起。疣状表皮发育不良，是属于罕见的遗传性皮肤病，考虑和遗传因素有关。
机体免疫力低的患者，皮肤容易受伤，受人乳头瘤病毒感染后，导致眼部皮肤出现赘生物。所以，眼上长疣，考虑和人乳头瘤病毒感染有关。机体免疫力低下的患者，更容易发生病毒疣。