运动后小腹疼痛，考虑跟运动剧烈、运动前准备不充分、消化不良、肠痉挛、输尿管结石等原因有关。建议及时就医，在医生指导下给予相应的改善或治疗措施。具体如下：
1、运动剧烈：如果运动过程中过于剧烈，可能会导致胃肠道的血流量减少，因此会出现小腹疼痛症状，这种情况一般比较正常，休息几个小时之后就会自行恢复，不必紧张。
2、运动前准备不充分：部分人群在运动前准备不充分，没有进行热身运动，可能会导致乳酸堆积，因此会出现疼痛症状，这种情况一般比较正常，可以进行局部热敷，比如用热水袋或热毛巾热敷，热敷时间大概是10~20分钟，可以每天热敷1~3次。同时还需多休息，对个人身体恢复有帮助。
3、消化不良：如果运动之前饮食过多，有消化不良的情况存在，运动过程中胃肠道内的食物还没有完全消化吸收，可能会导致小腹疼痛、恶心等症状出现，一般可以在医生指导下使用健胃消食片、大山楂丸、越鞠保和丸等药物治疗。
4、肠痉挛：如果平时生活中经常进行剧烈运动，导致肠道神经系统紊乱，肠道血管收缩，出现肠痉挛，因此可能会有比较明显的疼痛症状出现。可以在医生指导下使用消旋山莨菪碱片、阿托品片、颠茄片等药物治疗。
5、输尿管结石：如果饮食不当，活动较少，可能会诱发输尿管结石，运动过程中输尿管结石刺激输尿管黏膜，可能会导致疼痛、肿胀等症状出现，可以在医生指导下使用肾石通颗粒、排石颗粒、碳酸氢钠片等药物治疗。
除此之外，也可能是其他因素导致的，例如肠扭转。平时需适当进行体育运动，不建议运动过度，同时还需适当休息。