屁股主要指臀部。跑完一千米臀部疼可能是运动过度、肌肉劳损、腰肌劳损、髋关节滑膜炎、梨状肌综合征等原因导致。建议患者及时就医，明确病因后，在医生指导下给予相应的治疗措施。具体分析如下：
1、运动过度：长时间久坐或者不运动，突然间进行剧烈运动，肌肉中的部分细胞在做无氧呼吸形成乳酸，引发臀部出现酸痛感。这是正常现象，无需特殊治疗，注意避免长时间久坐，让臀部肌肉得到放松。也可以进行下肢的拉伸锻炼，一般采取双侧下肢并拢直立，然后用双侧上肢触碰脚后跟，用上半身与下半身贴紧的方式进行拉伸。
2、肌肉劳损：跑步过程中髋关节可能会反复旋转活动，使臀部的肌肉发生严重劳损，出现臀部肌肉酸胀、疼痛等症状，由于肌肉内的乳酸堆积过多，刺激神经末梢而造成。患者需要注意休息，以免加重肌肉劳损。如果患者疼痛症状比较严重，可以在医生指导下使用布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物进行治疗，减轻疼痛。
3、腰肌劳损：当从事重体力劳动，由于背部经常过度负重，可能会引起腰部的软组织损伤，在没有进行运动时，可能没有明显症状。跑完一千米后，由于运动量过大，可能会造成损伤进一步加重引起疼痛。应立即停止活动，休息一段时间。可以躺下或坐下，放松腰部肌肉，以帮助减轻疼痛。也可以佩戴腰带或腰托，减轻腰部肌肉的负担。
4、髋关节滑膜炎：当患有髋关节滑膜炎以后，由于炎症的渗出物会刺激周围的神经组织，出现疼痛。但是臀部神经组织和髋关节神经组织是交叉存在，所以会使患者在跑步以后出现臀部疼痛。首先加强髋关节周围的肌肉韧带的强度，能够更好的保护关节，增强关节的稳定性。如果疼痛严重，可遵循医嘱口服美洛昔康片、塞来昔布胶囊、洛索洛芬钠片等药物治疗，能够有效消除关节的滑膜炎症，降低炎症因子的产生，减轻疼痛。
5、梨状肌综合征：通常是因为过度运动、受到刺激，可能会容易引起梨状肌综合征症状加重，出现臀部疼痛、行走困难等症状。可以遵医嘱使用塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片、甲钴胺片等药物进行治疗，能消炎止痛。
建议在日常生活中要纠正不正确的姿势，并且要避免长时间的跑步。适当对臀部进行按摩、热敷等物理疗法，通常可以促进局部血液循环，进而减轻疼痛症状。