医生一般称肠镜为纤维结肠镜，因为一般的肠镜通常检查不到小肠，主要是检查结直肠这一部分。
纤维结肠镜主要是通过肛门进行逆行的入境，在做肠镜之前，有一个比较痛苦的过程，就是喝泻药进行肠道准备，把前一天或者是当天早上的东西，通过大便排干净，然后医生还要做一些身体状况的评估，查看有没有禁忌症；在做肠镜的过程中，首先会从肛门进境，然后一边充气一边逆行进镜，检查到整个大肠，包括直肠、结肠，一直检查到阑尾和小肠交界的回盲瓣部位。
因为多数人对于普通肠镜的耐受程度相对是较差的，所以建议尽量接受无痛肠镜的检查。无痛肠镜的检查会持续多长时间，主要取决于做肠镜时的难易程度，因为肠镜进入后，肚子会有拐弯的部位，有些人的弯好过，但有些人的弯可能就不好过，比如特别胖或特别瘦的人；还取决于做肠镜的内容，比如如果肠内有很多息肉，可能医生碰到一个息肉就会看一下，这样也会使检查的时间变长。
如果是做完无痛肠镜，可能会在醒来后有一点头晕，但是基本上不会影响到定位能力，所以做完无痛肠镜后，一般也没有特别需要注意的事项，除非在做肠镜的时候进行了一些特殊的操作，比如发现特别大的息肉，进行了活检，或者是肿瘤在活检的时候有出血，医生进行了止血操作等，这些特殊的情况下，医生都会下特殊的医嘱，严格按照医嘱做好护理即可。