嘴唇内部长水泡可能与病毒感染、手足口病、过敏等原因导致的。建议及时去医院就诊，明确病因后针对性治疗，临床治疗时多会选择药物方式，具体情况如下：
1、病毒感染：患者在发作早期局部常自觉灼热，随后出现红斑、簇集状小丘疹和水疱，水泡之间可以相互融合，数天后水疱破溃形成糜烂、结痂继而愈合，通常不留疤痕，病程1~2周。一般为自限性的，可以自愈，通常也不需要特殊处理。如果小范围的皮肤黏膜破损，可采用局部抗感染治疗，比如：夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏、阿昔洛韦乳膏等。
2、手足口病：以5岁以下儿童发病为主，为不同类型肠道病毒感染而发病，疱疹多位于口唇、舌、颊黏膜等处，常发生溃疡，多在一周内痊愈，预后良好。建议采用温水、开喉剑、银离子来喷口腔，改善症状。
3、过敏：多是由于接触了特定的食物、药物等导致的，起泡较迅速，可伴有其他接触部位有过敏反应。建议远离过敏源，必要时口服抗组胺类药物治疗，比如：西替利嗪、氯雷他定、依巴斯汀等。