硬化萎缩性苔藓积极对症治疗，癌变的几率不大，但任其发展，或者是长时间得不到有效的治疗，癌变的几率会增加。硬化萎缩性苔藓属于慢性炎症性皮肤黏膜性疾病，确定患有硬化萎缩性苔藓后，建议在医生指导下采用药物、手术、物理方法等治疗，降低癌变几率，具体情况分析如下：
患有硬化萎缩性苔藓后，建议在医生指导下使用糖皮质激素、免疫抑制剂等药物治疗，比如：糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏、吡美莫司乳膏等，改善症状。另外，也可以采用激光、液氮冷冻等物理方法治疗。甚至对于硬化萎缩性苔藓引起尿道狭窄、包茎、阴道口狭窄等情况时，需要选择手术治疗，比如尿道重建术、包皮环切术、会阴部再造术等。
对于患有硬化萎缩性苔藓者，经过上述方法积极治疗后，多可以控制病情进展，所以癌变几率比较小。
对于患有硬化萎缩性苔藓的患者，如果不及时治疗，有可能会出现白色硬化性丘疹、瘙痒等症状，任其病情发展，有可能会导致局部组织变性，增加患有癌变几率。