尖锐湿疣治疗3次后仍然复发的原因较多，可能是患者自身免疫力差、不注意防护导致的。也有可能是医生操作不当或药物不对症等引起的。

一、自身因素

1.自身免疫力差：如果患者的免疫功能低下，则无法清除体内病毒，容易造成尖锐湿疣反复发作；

2.不注意防护：在治疗期间没有做好护理工作，如性生活频繁或者与他人共用私人物品，可能会导致病情加重，从而引起疾病反复发作。

二、其他因素

1.医生操作不当：若是在治疗时选择的是激光或者是冷冻的方法，并且医生的技术水平不好，在治疗的过程中对局部组织损伤比较大，就可能导致皮肤出现坏死的情况，也会使病情反复发作；

2.药物不对症：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染所引发的一种传染性疾病，可采取外用药物以及口服药物的方式进行治疗。如果使用的药物不对症，可能无法达到去除病原体的效果，因此会导致病情反复发作。

建议患者平时要养成良好的生活习惯，避免不洁的性生活，也要禁止多个性伴侣。同时还要注意个人卫生，勤换洗内裤，并经过暴晒处理。饮食上可以多吃富含维生素的食物，比如苹果、橙子、猕猴桃等，能够补充身体所需要的营养成分，提高自身的抗病能力。