三个月的宝宝念珠菌感染多久能好，一般需要根据病情严重程度、治疗方案等因素进行综合判断。通常情况下，如果病情较轻，可能在1-2周左右恢复；但如果病情较重，则可能需要3-4周才能恢复。

念珠菌感染是一种真菌感染性疾病，多见于免疫力低下的人群，如婴幼儿、老年人等。该病主要通过接触感染部位或污染物而传播。临床上常表现为皮肤红斑、水疱、糜烂等症状。对于症状较轻的患儿，可以遵医嘱使用抗真菌药物进行治疗，如伊曲康唑胶囊、氟康唑片等。同时，还可以配合外用药物进行治疗，如克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等。一般经过积极治疗后，可以在1-2周左右恢复。

但若患儿病情比较严重，并且伴有明显的瘙痒症状，则需要及时就医，在医生指导下使用碳酸氢钠溶液清洗患处，并涂抹酮康唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等药物进行治疗。此时通常需要3-4周的时间才能恢复。

建议家长平时要注意保持宝宝的个人卫生清洁，勤洗澡、勤换洗衣物。同时还要注意合理饮食，避免吃辛辣刺激性的食物。若出现不适症状时，应及时到医院就诊治疗。