精子畸形率高，能否怀孕，需要根据引起精子畸形率高的原因进行分析，常见原因有内分泌功能紊乱、慢性前列腺炎、精索静脉曲张、不良生活习惯等。

1、内分泌功能紊乱：如果男性存在内分泌功能紊乱的情况，可能会导致精子的生成以及排出异常，从而会影响到精子的质量，导致精子畸形率高。建议男性去医院进行精液常规检查，明确诊断后遵医嘱使用激素类药物进行调理，如睾丸片、甲睾酮片等，改善精子畸形率为何种原因所致，精子畸形率异常后可尝试怀孕;

2、慢性前列腺炎：慢性前列腺炎可能会影响精液质量，导致精子畸形率高。建议男性遵医嘱使用抗生素进行治疗，如盐酸左氧氟沙星胶囊、阿奇霉素片等，改善精子畸形率为何种原因所致;

3、精索静脉曲张：患有精索静脉曲张疾病时，可能会使睾丸部位的血液不流通，导致生精功能出现障碍，从而使精子畸形率高。建议患者遵医嘱使用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗，必要时可进行手术治疗，如腹腔镜下精索静脉高位结扎术;

4、不良生活习惯：如果男性存在经常熬夜、吸烟、饮酒等不良生活习惯，可能会导致精子质量不好，出现畸形率高的情况，建议男性改善不良生活习惯，避免熬夜，戒烟、戒酒，同时注意饮食均衡、营养，适量进行体育锻炼，如游泳、打篮球等，通常可以改善精子畸形率为何种原因所致的这种情况;

5、其他原因：如果男性存在生殖系统感染疾病，如附睾炎、睾丸炎等，也可能会导致精子受到感染，从而导致精子畸形率高。建议男性遵医嘱使用头孢拉定胶囊、头孢地尼分散片等药物进行抗感染治疗，改善精子畸形率为何种原因所致。