小孩子包皮过长翻着疼可能是由于包皮龟头炎、尿路感染、尿道结石、包皮嵌顿导致，建议小孩子及时到医院就诊，在医生的指导下进行针对性治疗。

1、包皮龟头炎：由于小孩子包皮过长导致尿液堆积在包皮内，残留的尿液与包皮分泌物可刺激龟头，从而引发炎症，炎症长期刺激可出现小孩子包皮过长翻着疼的现象。小孩子可以在医生指导下使用克霉唑乳膏、红霉素软膏等药物进行治疗，同时注意局部卫生;

2、尿路感染：由于小孩子包皮过长，排尿时尿液容易堆积在包皮内，导致细菌大量滋生，长时间刺激可出现尿路感染，炎症因子刺激可导致小孩子包皮过长翻着疼。小孩子可以在医生指导下使用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗;

3、尿道结石：小孩子包皮过长时，尿道口难以清洁，尿液容易堆积在包皮内，与尿液中的沉积物可形成结石，结石刺激会导致小孩子包皮过长翻着疼。小孩子可以在医生指导下使用碳酸氢钠片、枸橼酸氢钾钠颗粒等药物进行治疗，也可通过手术的方式将结石取出;

4、包皮嵌顿：若小孩子包皮过长且存在包茎的情况，清洁卫生不到位时可引起包皮嵌顿，出现小孩子包皮翻着疼的现象。小孩子需要及时就医，由专业医生进行手法复位，必要时可进行手术治疗。