精子畸形症患者的治疗时间，通常需要根据引起精子畸形症的原因进行分析，常见原因包括不良生活习惯、环境污染、泌尿生殖系统感染，以及遗传疾病等。

1、不良生活习惯：如果患者存在经常熬夜、抽烟、喝酒等不良生活习惯，可以导致精子畸形率增加。一般通过戒除以上不良生活习惯，改善精子畸形率高的情况，如避免熬夜、戒烟酒，同时注意个人卫生，勤换内裤，避免不洁性生活等，通常治疗时间相对较短，但由于个体差异，一般无法确定具体治疗时间;

2、环境污染：如果患者受到环境污染的影响，如空气中的甲醛、苯、铅等污染，可能会导致精子质量下降，出现精子畸形症。此时通过更换生活环境，积极锻炼身体，一般需要三个月左右的时间能好;

3、泌尿生殖系统感染：如果患者出现急、慢性的前列腺炎或精囊炎等疾病，可以导致精子受到感染，从而出现精子畸形症。患者通过及时、规范地治疗，一般需要六个月左右的时间能好;

4、遗传疾病：如染色体异常的精子症患者，一般治疗难度较大，因为染色体异常导致的精子畸形率高，而且治疗周期也较长。这种情况无法通过药物治疗进行改善，只能通过人工辅助生殖技术帮助怀孕，因此治疗时间相对较长。

精子畸形症患者在治疗期间应注意饮食调节，可以多食用富含锌元素和硒元素的食物，如牡蛎、花蛤蜊、海参、动物肝脏等，有利于改善精子质量。除此之外，还应注意适度锻炼身体，如跑步、打羽毛球等，也有利于改善精子畸形症。