检查精子畸形的价格大概在1000-2000元，具体价格需要根据检查精子畸形的方法来决定，临床上比较常用的检查精子畸形方法主要包括精液常规检查、精子形态分析、染色体检查、尿常规检查等。

1、精液常规检查：精液常规检查需要先检查精液量、精子液化情况、精子浓度、精子畸形率、活率以及精子活动力等，总体正常值在15%-20%，如果出现异常，需要根据具体情况分析，因此价格会相对较高，大概在1000元;

2、精子形态分析：精子形态分析是指对精子的头、体、尾等部位进行形态学检查，主要包括头部畸形、颈部畸形、无尾形等，正常形态精子的比例在2%以上，如果正常形态的精子比例下降，会影响受孕几率，因此价格也会相对较高，大概在2000元;

3、染色体检查：染色体检查主要是针对染色体异常的检查，常用于不育症的检查，正常男性的染色体为46XY，正常女性的染色体为46XX。不同医院存在不同的收费标准，如果想要进行精子DNA碎片率检测，一般需要50-100元，如果想要检查染色体微缺失或微重复，一般需要200-800元;

4、尿常规检查：尿常规检查一般是对尿液进行化验，主要包括尿蛋白、红细胞、白细胞以及细菌等方面，可以初步判断是否存在泌尿系统疾病，对于泌尿系统疾病的诊断以及治疗都有重要的意义，由于仪器设备比较先进，所以价格也会比较高，大概在1000元。