精子畸形不一定是染色体异常，还可能存在其他原因，导致精子畸形的原因较多，主要包括不良生活习惯、泌尿生殖系统感染、内分泌异常、遗传疾病等。若怀疑精子畸形，可以及时到医院进行相关检查，明确是否存在染色体异常。

1、不良生活习惯：可能是由于长时间抽烟、喝酒，以及过度熬夜、饮食不规律等因素导致，也可能是由于接触到放射线、铅、苯等有毒有害物质导致。一般会使精子的基因和蛋白质结构发生改变，从而导致精子畸形;

2、泌尿生殖系统感染：男性泌尿生殖系统受到病原体感染时，也可能导致精子畸形，如前列腺炎、尿道炎、睾丸炎等，可能会导致精子在生成过程中受到影响，使精子畸形率增高;

3、内分泌异常：当女性患有内分泌疾病时，如垂体功能减退、甲状腺功能亢进等，可能导致雄激素水平下降，使促性腺激素减少或者延迟，从而导致精子的生成出现异常，引起精子畸形;

4、遗传疾病：主要是存在家族遗传史，存在精子畸形的家族遗传史时，后代出现精子畸形的概率会明显增高。主要是由于染色体异常会导致精子在生成过程中出现异常，所以会引起精子畸形;

5、其他原因：若男性长期处于不良的生活环境中，如受到辐射、空气污染等，或长期服用化学药物、经常熬夜等，也可能导致精子畸形。若男性存在腮腺炎、睾丸炎等炎症性疾病，或受到放射线照射，以及长期接触重金属等，也可能导致精子畸形。