精子畸形率高，会影响男性生育能力。一般治疗方法包括改变不良生活习惯、药物治疗、手术治疗、辅助生殖等，需要根据导致精子畸形率高的原因进行针对性治疗。

1、改变不良生活习惯：如果男性长期抽烟、喝酒或熬夜，可能会导致精子畸形率高，建议男性改变以上不良生活习惯，可以适当进行体育锻炼，戒烟戒酒，早睡早起，合理作息;

2、药物治疗：精子畸形率高可能是由于睾丸炎、附睾炎等生殖系统炎症导致，可以遵医嘱使用抗生素进行抗炎治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒、盐酸左氧氟沙星胶囊等。如果由于缺乏微量元素导致，可以通过口服维生素片或补充微量元素改善;

3、手术治疗：如果精子畸形率高是由于精索静脉曲张等疾病造成，可以通过手术进行治疗，如精索静脉高位结扎术等;

4、辅助生殖：如果男性存在弱精症导致精子畸形率高，可以通过人工授精或试管婴儿辅助生育，通过非性交体外受精的方法帮助男性生育能力，达到受孕的目的。

部分男性精子畸形率高是由于染色体异常导致，建议夫妻双方在备孕期间进行产前检查，若发现问题及时进行纠正，可以提高精子和卵子质量，有利于优生优育。男性在备孕期间要注意戒烟戒酒，避免熬夜，保证充足睡眠，注意适当运动，增强体质，有利于提高精子质量。