精子DNA碎片率与胎儿畸形的关系，目前尚未有明确的结论。但研究发现，精子DNA碎片率升高可能与男性不育、胚胎发育不良、自然流产等生殖系统疾病有关。

1.男性不育：精子DNA碎片率高会导致精子活力下降，从而影响受精卵的形成和着床，最终导致男性不育。精子DNA碎片率高还可能导致精子畸形率增加，进一步影响受孕机会。

2.胚胎发育不良：精子DNA碎片率高可能会导致胚胎发育不良。研究表明，精子DNA碎片率高的男性生育的胎儿发生先天性缺陷的风险较高。这些缺陷包括无脑儿、脊柱裂、心脏缺陷等。

3.自然流产：自然流产是由于多种因素引起的妊娠早期或中期终止的现象。研究发现，精子DNA碎片率高的男性更容易发生自然流产。这可能是由于精子DNA碎片率高会影响受精卵的质量和稳定性，从而导致胚胎发育异常或停止发育。

精子DNA碎片率与胎儿畸形有一定的关系，但具体机制尚不清楚。在备孕期间，建议男性保持良好的生活习惯，避免吸烟、饮酒等不良习惯，并定期进行体检和检查精子质量。如果出现任何不适症状或疑虑，请及时咨询医生并接受专业治疗。