检查精子一般不可以发现胎儿畸形。精子的检查在临床上通常是指精液常规检查，精液常规检查主要包括精液体积、精子液化情况、精子浓度、精子活动率、正常形态等，这些指标能够判断男性是否存在生殖系统疾病，而胎儿畸形常见的主要是先天性愚型、染色体异常等。

1、精液体积：正常男性的精液量为2-5mL，如果少于2mL，称为少精子症。如果超过7mL，称为无精子症，也属于异常现象;

2、精子液化情况：正常情况下精液为乳白色、灰白色，如果长时间未排出或者排出不畅，就可能会导致精子液化异常，出现白色颗粒或者黄色颗粒等;

3、精子浓度：正常男性的精子浓度在每毫升1500万以上，当低于1500万时可能提示存在少精子症。而如果出现浓度过低，可能就会导致受孕困难;

4、精子活动率：正常男性的精子活动率在每分钟1500次以上，如果正常活动率比较低，就可能会影响受孕;

5、正常形态：正常形态的精子可以达到4%以上，如果正常形态的精子小于4%，也可能提示存在少精子症。

由此可见，想要检查胎儿是否存在畸形，不能单纯依靠精液常规检查进行判断。还需要结合彩超检查、染色体检查等进行综合分析。