精子畸形率高的男性可以自然受孕，精子畸形率在临床通常是指高倍镜下精子的畸形率，正常男性精子的畸形率应在4%以下，如果畸形率过高，就会影响精子的质量，可能会导致自然受孕的几率下降，严重时可能导致不育。

1、轻度精子畸形率：精子的畸形率在4%以下时，可以通过多种方法来改善精子质量，如戒除烟酒、避免熬夜、健康饮食、加强锻炼等，也可以配合使用中成药物，如复方玄驹胶囊、五子衍宗丸等，治疗一段时间后，精子畸形率高的情况会逐渐下降，此时精子的质量也会有明显提高，可以达到自然受孕的目的;

2、中重度精子畸形率：当中重度精子畸形率达到70%及以上时，比较难自然受孕，因为这种情况很难通过常规方法改善，需要通过人工辅助生殖技术来帮助怀孕，如试管婴儿等;

3、严重精子畸形率：当严重的精子畸形率达到100%时，正常情况下不会自然受孕，因为这种情况会导致精子在体内的存活率、活动力下降，即使侥幸怀孕也容易发生流产或胚胎停育现象。如果精子畸形率特别高，建议通过药物和手术来进行治疗，常用的药物有左卡尼汀、中成药物等，需在医生指导下使用;

4、其他情况：当检查发现精子畸形率过高时，同时发现存在弱精症的情况，此时是否可以自然受孕要根据具体情况来判断。

精子畸形率高的男性要避免吸烟、喝酒等不良生活习惯，同时建议加强锻炼、规律作息，这样有利于提高精子质量。如果精子畸形率过高是由疾病导致，则要及时就诊、检查，进行针对性治疗。