精子畸形率是指精液中正常精子的比率，而男性长期加班熬夜可能会导致精子畸形率升高。如果出现这种情况，建议及时到医院就诊，由医生明确具体原因后进行针对性处理。

1、环境因素：如果男性长期处于高温环境中，比如经常泡温泉、蒸桑拿等，或者是长期接触有毒有害物质，如重金属铅、汞等，都可能会影响睾丸生精功能，从而引起精子畸形率升高的情况；

2、药物因素：如果男性长期服用抗肿瘤药物、抗精神病药物、抗抑郁药物等，也有可能会导致精子畸形率升高。因为这些药物可能会对生殖系统造成影响，从而导致精子质量下降；

3、疾病因素：如果男性存在附睾炎、前列腺炎等疾病，由于炎症刺激也会导致精子畸形率升高。如果男性存在精索静脉曲张的情况，也有可能会导致局部血液循环不畅，从而影响睾丸生精功能，也有可能会引起精子畸形率升高；

4、其他因素：如果男性长期吸烟喝酒或过度肥胖，则可能会导致体内雄激素水平下降，进而影响睾丸生精功能。此时也有可能会导致精子畸形率升高。

在日常生活中应避免熬夜以及过度劳累。同时还要注意饮食健康，可以适当吃富含优质蛋白的食物，比如鸡蛋、牛奶等。