精子畸形率高是否会影响胚胎的质量需要根据具体情况判断。如果只是轻度的精子畸形，一般不会对胚胎造成不良的影响；但如果精子畸形严重，则可能会导致胚胎发育异常。

1.不影响：如果是由于长期吸烟、喝酒或者生殖系统感染等因素引起的轻微精子畸形，这种情况一般是不会影响到胚胎质量的，也不会出现其他不适症状。建议患者在日常生活中要养成良好的生活习惯，避免过度劳累以及熬夜等现象发生，同时也要注意饮食清淡营养均衡，多吃新鲜水果蔬菜以及富含优质蛋白的食物，增强自身免疫力和抵抗力，有利于病情恢复。

2.影响：但若精子畸形比较严重，并且长时间得不到改善，则会对胚胎的质量造成一定的影响，甚至还会引起胎儿畸形的情况发生。此时则需要及时去医院进行检查并治疗，以免延误病情。

在日常生活中一定要做好个人卫生工作，勤换洗内裤，也可以每天使用温水清洗私处，能够预防炎症感染的发生。另外还要保持乐观向上的心态，积极配合医生进行治疗，定期复查。