连花清瘟和蓝芩口服液虽然都是清热型中成药，但是二者的区别主要体现在药物成分不同、功效不同，治疗的疾病不同等方面。

1、成分不同：连花清瘟由石膏、炒苦杏仁、炙麻黄、金银花及连翘等药物成分组成；蓝芩口服液由板蓝根、胖大海、黄柏、栀子及黄芩等药物成分组成；

2、功效不同：连花清瘟不仅有清瘟解毒的功效，还可以达到宣肺泄热的作用。蓝芩口服液主要具有清热解毒、利咽消肿的功效；

3、治疗的疾病不同：服用连花清瘟可以辅助治疗流行性感冒属热毒袭肺症，临床表现为四肢酸痛、鼻塞、流鼻涕、咽干咽痛、头痛、咳嗽以及舌苔黄腻等症状。而服用蓝芩口服液主要治疗急性咽炎、肺胃实热症引起的咽部疼痛、咽部干痒及咽部灼热感等症状。

服用药物时需要在医生的指导下进行，不可以私自、盲目服用，以免服用药物不当，对身体健康造成影响。服药期间应忌烟忌酒，忌辛辣、生冷等刺激性食物，多喝水，适量运动。