甲减一般是指甲状腺功能减退，服用甲状腺激素类药物后精子畸形率是否高，需要根据患者病情的严重程度进行判断。如果患者病情较轻，通常不会对精子造成影响，但如果患者病情较重，则可能会导致精子畸形率升高。

1、可能不高的情况：甲状腺功能减退是由于自身免疫性疾病、甲状腺破坏等原因所引起，会导致体内甲状腺素分泌不足，从而出现身体乏力、怕冷、食欲减退等症状。如果患者病情较轻，只是出现了轻微的不适症状，并且在医生指导下服用了左甲状腺素钠片等药物进行治疗，通常不会对精子造成影响，也不会导致精子畸形率升高；

2、可能较高的情况：如果患者病情较重，出现了明显的不适症状，并且没有及时遵医嘱用药治疗，则可能会导致体内的甲状腺素分泌不足，使睾丸组织受到损伤，从而引起精子畸形的情况。此时则可能导致精子畸形率升高。

建议患者及时到医院内分泌科就诊，在医生指导下完善血常规检查、尿常规检查等明确诊断。同时在日常生活中还要注意饮食清淡，可以适当吃富含蛋白质的食物，如鸡蛋、牛奶等。