精子畸形率高、活动度低可能是长期熬夜、饮食不合理、前列腺炎、精囊炎等因素所导致，可通过口服药物、手术等方式进行治疗。

1、长期熬夜：如果患者长期熬夜，会导致机体长时间处于疲劳状态，会影响体内激素水平，导致精子的畸形率高、活动度低，长期以往还会导致精子活力降低，影响生育能力。建议患者养成良好的作息习惯，避免长期熬夜;

2、饮食不合理：如果长期进食油腻、辛辣、刺激性的食物，比如肥肉、辣椒、花椒等，会影响身体正常的新陈代谢，同时还会影响精子的质量，从而导致精子畸形率高、活动度低。建议患者多吃一些新鲜的水果和蔬菜，比如苹果、西红柿、黄瓜等，能够补充机体所需要的营养物质，对身体健康有一定好处;

3、前列腺炎：患者不规律性生活、久坐等因素可能会诱发前列腺炎，如果患者不及时治疗，随着病情发展，细菌可能会经血液循环在前列腺部滞留，并侵入前列腺组织，使前列腺液分泌功能异常，从而导致精子畸形率高、活动度低。患者可遵医嘱服用盐酸环丙沙星胶囊、氧氟沙星胶囊等药物进行治疗;

4、精囊炎：通常是细菌感染所引起，患者不注意局部卫生清洁，容易诱发细菌感染，而炎症刺激会改变精液成分，导致精子畸形率高、活动度低。患者可遵医嘱服用头孢地尼分散片、阿奇霉素片等药物进行治疗。

建议患者在治疗期间应避免进行性生活，以免导致病情加重，不利于疾病恢复。同时建议患者去医院的男科就诊，进行精液常规检查、血常规等检查，明确病因后配合医生治疗。